Pada awal film, 20 tahun yang lalu di bulan, empat Ultra bersaudara—Ultraman, Seven, Jack, dan Ace—bertarung melawan musuh mematikan bernama Yapool, monster yang berukuran beberapa kali lipat dari mereka. Dalam pertarungan tersebut, Yapool unggul dan menggunakan cakar-cakarnya untuk mencengkeram para Ultra bersaudara. Meskipun mereka berhasil melepaskan diri dengan kekuatan mereka dan melancarkan serangan kombinasi Specium Ray, serangan itu tidak membuahkan hasil. Monster itu kemudian terbang menuju Bumi untuk menghindari serangan, dan para bersaudara mengejarnya. Mereka nyaris tidak bisa mengalahkan Yapool, namun monster itu tetap harus disegel. Demi menyegel Yapool, mereka terpaksa melepaskan kemampuan untuk bertransformasi, dan mengambil pekerjaan di wilayah Kobe demi berjaga-jaga jika monster itu kembali suatu hari nanti.
